W latach 2000-2020 pracownicy ZHP prowadzili badania koncentrujące się na procesach zasilania, przepływu i drenażu wód podziemnych na obszarze Sudetów. W roku 2015 zapoczątkowano stopniowy proces zmieniający profil badawczy zakładu na rzecz zagadnień związanych hydrogeologią obszarów zurbanizowanych.

Aktualnie, główne cele badawcze wpisują się w priorytetowe obszary badawcze i koncentrują się na tematach związanych z:

– prognozowaniem zmian zasobów wodnych w wyniku zmian klimatycznych i ich wpływu na społeczeństwo

– zagrożeniami i wyzwaniami zrównoważonego wykorzystania zasobów wód podziemnych i zagospodarowania wód opadowych w aspekcie prognozowanego rozwoju aglomeracji miejskich

– rozpoznawaniem gezy wód podziemnych i ograniczaniem migracji zanieczyszczeń